Científico británico asegura que el nuevo coronavirus pudo originarse en septiembre

Wuhan podría no ser el lugar de origen, de acuerdo con este estudio
(Imagen: Pixabay)

El brote inicial del nuevo coronavirus que causa COVID-19 podría haber comenzado a mediados de septiembre, y la ciudad china de Wuhan podría no ser donde comenzó, dijo un científico que analiza los orígenes de la enfermedad.

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Investigadores de Cambridge, Gran Bretaña y Alemania han utilizado una técnica de red genética conocida como análisis de red filogenética para reconstruir los primeros caminos evolutivos del nuevo coronavirus,  SARS-CoV-2 en humanos a medida que la infección se propagó desde Wuhan a Europa y América del Norte.

Al analizar los primeros 160 genomas virales completos que fueron secuenciados a partir de pacientes humanos, los científicos dicen que han mapeado parte de la propagación original del nuevo coronavirus a través de sus mutaciones, lo que resulta en diferentes linajes virales. Los resultados del equipo identificaron tres variantes centrales, A, B y C, que se extendieron de manera diferencial.

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“Hay demasiadas mutaciones rápidas para rastrear cuidadosamente un árbol genealógico COVID-19”, explicó el genetista Peter Forster, doctor de la Universidad de Cambridge:

“Utilizamos un algoritmo matemático de red para visualizar todos los árboles plausibles simultáneamente. Estas técnicas son principalmente conocidas por mapear los movimientos de poblaciones humanas prehistóricas a través del ADN. Creemos que esta es la primera vez que se han utilizado para rastrear las rutas de infección de un coronavirus como COVID-19.” (Vía: South China Morning Post)

Forster es el autor principal del artículo del equipo, que se publica en Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) titulado: “Análisis de la red filogenética de los genomas del SARS-Cov-2”. El software utilizado en el estudio, así como las clasificaciones para más de mil genomas de coronavirus, están disponibles gratuitamente en Fluxus.

A principios de marzo de 2020, la base de datos GISAID (originalmente conocida como la iniciativa global para compartir todos los datos de influenza) contenía una compilación de 253 genomas completos y parciales del SARS-CoV-2 que habían sido aportados por médicos e investigadores de todo el mundo desde diciembre de 2019. Para tratar de comprender la evolución del coronavirus SARS-CoV-2, y para ayudar a rastrear las vías de infección y diseñar estrategias preventivas, Forster y sus colegas generaron una red filogenética de 160 genomas del SARS-CoV-2 en gran parte completos.

Sus resultados descubrieron tres variantes de SARS-CoV-2, que consisten en grupos de linajes relacionados, que designaron A, B y C. La variante A estaba más estrechamente relacionada con el virus encontrado en murciélagos y pangolines, y representa la raíz efectiva del brote. El tipo B se deriva de A, separado por dos mutaciones, luego C es a su vez un “hijo” de B. “En general, la red, como se esperaba en un brote en curso, muestra genomas virales ancestrales que existen junto a sus genomas hijos recientemente mutados”. (Vía: PNAS)

Forster y sus colegas descubrieron que el tipo A, que es el genoma original del coronavirus en humanos, estaba presente en Wuhan, pero sorprendentemente no era el tipo de virus predominante en la ciudad. Sus análisis mostraron que las versiones mutadas de A se observaron en estadounidenses que vivieron en Wuhan, y se encontró una gran cantidad de virus de tipo A en pacientes de los Estados Unidos y Australia.

El principal tipo de virus de Wuhan fue el linaje B, y esto fue frecuente en pacientes de todo el este de Asia. Sin embargo, la variante no viajó mucho más allá de la región sin más mutaciones, lo que implica un fundador incluso en Wuhan, o resistencia contra este tipo de COVID-10 fuera de Asia Oriental, anotaron los investigadores. La variante C se identificó como el tipo europeo principal y se encontró en pacientes tempranos de Francia, Italia, Suecia e Inglaterra. Estaba ausente de la muestra continental china del estudio, pero se encontró en Singapur, Hong Kong y Corea del Sur.

Es importante destacar que los investigadores dicen que sus técnicas de redes genéticas rastrearon con precisión las rutas de infección establecidas: las mutaciones y los linajes virales se unieron a los puntos entre los casos conocidos. “Una aplicación práctica de la red filogenética es reconstruir las rutas de infección donde son desconocidas y representan un riesgo para la salud pública”, declararon. Los investigadores describen una serie de casos en los que ya se conoce el historial de infección. Sus resultados sugirieron que una de las primeras introducciones del virus en Italia se produjo a través de la primera infección alemana documentada el 27 de enero, y que otra ruta temprana de infección italiana estaba relacionada con un “grupo de Singapur”. (Vía: PNAS)

“La red no sólo confirma el origen italiano del virus mexicano, sino que también implica que este virus italiano se deriva de la primera infección alemana documentada el 27 de enero en un empleado que trabajaba para la compañía Webasto en Munich, quien, a su vez, tenía contrajo la infección de un colega chino en Shanghai que había recibido la visita de sus padres de Wuhan”, escribieron los investigadores. (Vía: PNAS)

(Imagen: Pixabay)

“Este viaje viral de Wuhan a México, que dura un mes, está documentado por 10 mutaciones en la red filogenética”. Forster comentó: “La red viral que hemos detallado es una instantánea de las primeras etapas de una epidemia, antes de que los caminos evolutivos de COVID-19 se oscurezcan por un gran número de mutaciones. Es como atrapar una supernova incipiente en el acto “.

Ellos razonan que los métodos filogenéticos podrían aplicarse a la última secuenciación del genoma del coronavirus para ayudar a predecir futuros centros globales de transmisión y aumento de la enfermedad causada por el nuevo coronavirus. “Una aplicación práctica de la red filogenética es reconstruir las rutas de infección donde son desconocidas y representan un riesgo para la salud pública”, escribió el equipo, describiendo una serie de casos en los que el historial de infección ya era conocido. “El análisis de la red filogenética tiene el potencial de ayudar a identificar las fuentes de infección COVID-19 indocumentadas, que luego se pueden poner en cuarentena para contener una mayor propagación de la enfermedad en todo el mundo”, dijo Forster  (Vía: South China Morning Post)

Forster dice que los resultados sugieren que la primera infección y propagación entre humanos de COVID-19 ocurrió entre mediados de septiembre y principios de diciembre. Es por eso que la identificación de la fuente original del virus,es necesaria para garantizar que no vuelva a ocurrir. Comprender los diferentes tipos de virus y el papel que juegan en la propagación de COVID-19 es “una de las preguntas urgentes a considerar”, concluyó. (Vía: South China Morning Post)

Con información de South China Morning Post

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